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物理生命シミュレーション
| 科目名 | 物理生命シミュレーション | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| 教員名 | 末永 敦 | ||||
| 単位数 | 2 | 学年 | 3 | 開講区分 | 文理学部 |
| 科目群 | 生命科学科 | ||||
| 学期 | 後期 | 履修区分 | 選択 | ||
| 授業テーマ | 生命情報学の実践 |
|---|---|
| 授業のねらい・到達目標 | 生体高分子の配列解析、立体構造予測、薬剤分子の分子設計等の生命情報学ツールを自ら操作し、それら一連技術の修得を目標とする。 |
| 授業の方法 | インターネット上のツールや専用の分子設計支援ソフトを用いて、演習形式の授業を行う。 |
| 履修条件 | 使用ソフトライセンス数制限から、受講者数の調整を行うことがある。 |
| 授業計画 | |
|---|---|
| 1 | ガイダンス |
| 2 | 生物学データーベースの利用 |
| 3 | 配列比較 |
| 4 | 生体高分子の観察 |
| 5 | タンパク質の立体構造予測 |
| 6 | 文献データベースの活用 |
| 7 | 配列情報からのタンパク質の機能予測 |
| 8 | 構造情報からのタンパク質の機能予測 |
| 9 | ゲノムデータ |
| 10 | 生物情報ネットワーク |
| 11 | 薬剤の計算科学的分子設計 |
| 12 | 分子動力学シミュレーション |
| 13 | 文献調査 |
| 14 | 授業内容の整理 |
| 15 | 総括 試験の解説 質疑応答 |
| その他 | |
|---|---|
| 教科書 | 『Webで実践 生物情報リテラシー （広川貴次・美宅成樹）』 中山書店 2013年 第初版 |
| 参考書 | なし |
| 成績評価の方法及び基準 | 出席状況(50%)、課題発表(50%) |
| オフィスアワー | ８号館A210 随時（事前にアポイントをとること。アポイントのとりかたについては第一回目の授業時に説明） |
| 備考 | 生体情報学１、２を同時に選択していることが強く望まれる。 受講者数制限を行う可能性あり。 |